內(nèi)切酶是從細(xì)菌中分離出來的一種能在特異位點切割DNA分子的核酸內(nèi)切酶,目前已從多種細(xì)菌中分離出超過400種,識別各自不同的核苷酸順序,這一順序大多為具有一對稱中心的回文序列,如從大腸桿菌中分離的EcoR I識別:…GAATTC…切割后產(chǎn)生
…CTTAAG…
…G和AATTC…的末端
…CTTAA G…
該末端由于有一段小的能互補配對的單鏈突出,故稱為粘性末端。切割后的末端為3’-OH和5’-磷酸基團。即…G-OH
…CTTAA-P。
有的限制性酶識別四堿基對的順序,如San3A識別GATC;有的識別六堿基對,如上述的ECOR I。識別四堿基對的內(nèi)切酶由于識別順序在DNA出現(xiàn)的頻率更高(四堿基酶為44=256,六堿基酶為46=4096),因而可將DNA切割成更小的片段,而識別八堿基對的Not I
…GCGGCCGC…
…CGCCGGCG…。
則識別和切割位點更少(48=65536),但堿基并不以均等的概率出現(xiàn),因而切割后產(chǎn)生的片段變化范圍很大。
限制性內(nèi)切酶作用的溫度一般為37℃,反應(yīng)體系中以Mg2+為單獨的輔助因子,且要求pH緩沖在7.5左右。
商品酶都保存在50%的甘油溶液中,-20℃貯存,活性通常較高,5u/μl(每單位即最適條件下1小時內(nèi)*酶解1μg DNA的酶量)。